pH值對維持脫氮工藝的穩定的影響
 
大量研究表明，氨氧化菌和亞硝酸鹽氧化菌的適宜的pH分別為7.0～8.5和6.0～7.5，當pH值低于6.0或高于9.6時，硝化反應停止。硝化細菌經過一段時間馴化后，可在低pH值（5.5）的條件下進行，但pH值突然降低，則會使硝化反應速度驟降，待pH值升高恢復后，硝化反應也會隨之恢復。
 
反硝化細菌*適宜的pH值為7.0～8.5，在這個pH值下反硝化速率較高，當pH值低于6.0或高于8.5時，反硝化速率將明顯降低。此外pH值還影響反硝化*終產物，pH值超過7.3時終產物為氮氣，低于7.3時終產物是N2O。
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硝化過程消耗廢水中的堿度會使廢水的pH值下降（每硝化1g氨氮將消耗7.14g堿度，以CaCO3計）。相反，反硝化過程則會產生一定量的堿度使pH值上升（每反硝化1g硝酸鹽將產生3.57g堿度，以CaCO3計）但是由于硝化反應和反硝化過程是序列進行的，也就是說反硝化階段產生的堿度并不能彌補硝化階段所消耗的堿度。因此，為使脫氮系統處于*佳狀態，應及時調整pH值。
 
2、溫度（T）
 
硝化反應適宜的溫度范圍為5～35℃，在5～35℃范圍內，反應速度隨溫度升高而加快，當溫度小于5℃時，硝化菌代謝能力嚴重下降，幾乎停止活動；在同時去除COD和硝化反應體系中，溫度小于15℃時，硝化反應速度會迅速降低，對硝酸菌的抑制會更加強烈。
 
反硝化反應適宜的溫度是15～30℃，當溫度低于10℃時，反硝化作用快速下降，當溫度高于30℃時，反硝化速率也開始下降。
 
有研究表明，溫度對反硝化速率的影響取與反應設備的類型、負荷率的高低都有直接的關系，不同碳源條件下，不同溫度對反硝化速率的影響也不同。